单细胞/空间测序

单细胞/空间测序

可提供从单细胞水平对mRNA、染色质区域、免疫组库等的研究,解决组织样本无法获得不同细胞间异质性信息或样本量太少无法测序的难题。

 

 

10x Genomics单细胞转录组

利用油包水的微反应体系,通过序列标签区别群体中的不同细胞,获得单细胞水平的数字化基因表达谱,实现数千甚至数万个单细胞群体分析。

 

10x Genomics单细胞V(D)J

在单细胞水平同时实现免疫组库分析(TCR和BCR)和5’端基因表达谱分析,在解析免疫组库多样性,探索T/B细胞特异性抗原,描述肿瘤微环境等研究中有广泛应用。

 

10x Genomics单细胞表面蛋白

可同时完成对每个样本500-10000个细胞的基因表达和细胞表面蛋白表达情况的测定,从多角度阐述科研问题。

 

10x Genomics单细胞ATAC

在单细胞水平对细胞染色质开放区域进行研究,绘制细胞染色质开放区的单细胞图谱,是单细胞水平研究表观遗传学的有效手段。

 

10x Genomics单细胞多组学ATAC+转录组

同时分析同一细胞的基因表达和染色质可及性,能够助力表征细胞类型和状态的发现和基因调控程序鉴定。

 

10x Genomics 空间转录组

将基因空间表达可视化,在识别不同细胞群的同时保留空间背景,提供了关于组织微环境中细胞功能、表型和位置关系的关键信息。

 

单细胞全长转录组

可同时实现单细胞水平的基因表达定量和全长转录本可变剪切信息的获取,为探索疾病发生发展的分子机制提供强大的技术支撑。

 

 

文章案例

单细胞水平解读人类巨噬细胞的发育

中国人民解放军总医院第五医学中心研究人员利用单细胞转录组测序技术对人胚胎多位点(卵黄膜、头、肝、血液、皮肤和肺)进行分析,解析人巨噬细胞的发育。通过对卡耐基阶段11-23的胚胎多位点CD45+细胞进行分析,构建了人胚早期CD45+造血细胞的单细胞图谱;结合转录组、免疫表型和功能三个层面定义了人胚突破性的具有多系分化潜能的早些祖细胞群体,即非造血干细胞来源的在其髓系祖细胞YSMP;精准解析了巨噬细胞尤其是小胶质细胞的起源和特化过程,明确了人胚期巨噬细胞的多重起源,以及组织驻留型巨噬细胞特化过程关键分子特征。

 

 

参考文献

Bian Zhilei, Gong Yandong, Huang Tao et al. Deciphering human macrophage development at single-cell resolution [J]. Nature, 2020, 582: 571-576.