产品简介
本产品结合了饱和染料 EvaGreen 和抗体酶的优点,是一款适用于高分辨率熔解曲线(High Resolution Melting,HRM)分析的专业试剂盒。本品是一种 2× PreMix,PCR 反应液配制十分简单方便;具有分辨率高和模板高度适应性等特点。
与 SYBR Green 不同,EvaGreen 在高浓度情况下不会抑制 PCR 反应;可以使双链 PCR 产物的结合量达到饱和状态,所以称为“饱和染料”。不会产生 SYBR Green 的“染料重排”现象,能够很好的区分扩增产物之间单个碱基的差异。本产品可用于已知 SNP 分析,未知 SNP 筛选,以及未知突变基因扫描和甲基化 PCR 分析等研究。
产品特点
■ 高分辨率:采用 EvaGreen 饱和染料,在饱和状态下具很高的熔解曲线分辨率,可以区分单个碱基的变异。
■ 高特异性:采用抗体修饰的热启动 DNA 聚合酶,降低非特异性扩增,提高特异性。
■ 高稳定性:精心优化 Buffer 体系,增加了熔解曲线的稳定性,提高结果可信度。
■ ROX 校正:单独包装的 ROX 染料,使用更灵活,结果更准确。
下游应用
■ 已知 SNP 分型。
■ 未知 SNP 筛选。
■ 未知突变基因扫描。
■ 甲基化 PCR 分析。
实验结果
图1:使用DP348 提取100 μl 人类血液样本,上样量50 ng,根据NCBI SNP 数据库,选取FEN1 基因的已知SNP (rs174538) 使用Roche LightCycle480 检测,结果如下:
实验结果显示,HRM Analysis Kit 的相同基因型熔解曲线重复性高,不同基因型分辨明确,不存在误判,是理想的SNP 位点分析方法。
SNP 信息:......CGGAAGAACACGTCG[A/G]CAGGAGCAGGCGCCT...... (Allele Frequency:A=0.314,G=0.686)
引物:扩增108 bp 的片段(所用引物FEN1_F:CCTCAACGCTCTCACCATTTTG;
FEN1_R:GGCACTTCCTTTTCCGGTTGTG)
根据NCBI SNP 数据库,选取已知的SNP 进行检测,检测的SNP 信息如下:
RefSNP number:rs174538
Gene Name:FEN1 (flap structure-specific endonuclease 1)
序 列:CGCTCCGCCACCGGAAGAACACGTCG[A/G]CAGGAGCAGGCGCCTAGCACAACCG
Allele Frequency:A=0.314,G=0.686
根据该SNP 位点两侧序列信息,设计引物:FEN1_F:CCTCAACGCTCTCACCATTTTG;
FEN1_R:GGCACTTCCTTTTCCGGTTGTG;扩增PCR 产物长度为108 bp。配置反应体系,在Roche LightCycle480 仪器上运行,检测24 个个体,结果如下:
图2. 对已知SNP 进行检测,NCBI Assay ID 为ss869699;PCR 产物长度为108 bp;24 个检测样本。Roche LightCycler 480 仪器运行,收集熔解曲线信号参数:Ramp Rate 0.05;Acquisitions 12; Genescanning 方法分析。结果中可以看出,HRM Analysis Kit 的不同基因型分辨明确,相同基因型熔解曲线重复性高,不存在误判。
仪器要求
HRM 对仪器的要求较高,ABI 7500 Fast ,ABI 7900HT,Roche LightCycler 480,Qiagen Roter-Gene 等配合专用软件可进行HRM 实验。
Copyright © 2021 新疆宝信源柏生物技术有限公司 版权所有!
新ICP备2022000265号-1 新公网安备 65010502000866号