产品简介
TIANSeq Fast RNA Library Prep Kit (Illumina) 是针对Illumina 高通量测序平台开发的非定向转录组文库构建专用试剂盒,可用于常规转录组分析及 LncRNA 等非编码RNA 的分析。本试剂盒采用快速一管式的操作流程,可对RNA 样本进行快速文库构建,在双链 cDNA 合成后,样本的末端修复和 dA 尾添加在一步完成,所得产物无需纯化即可直接用于接头的连接。此外,试剂盒采用专门设计的高效高保真聚合酶,所获得的 PCR 富集产物保真度高、无碱基偏好性。
试剂盒所适用的起始样本为将总 RNA 中的 rRNA 去除的RNA(保留了 mRNA 和其他的非编码 RNA)或者从总RNA 中直接分离获得的 mRNA。总 RNA 样本的起始模板量为 10 ng~1 μg;mRNA 样本的起始模板量低至 500 pg。
产品特点
■ 可针对 mRNA 和除 rRNA 外的非编码 RNA(如 lncRNA)进行转录组分析。
■ 操作流程简便,可实现 RNA 样本的快速文库构建。
■ 文库转化率高,适用于极低起始量样本文库的高效转化。
■ PCR 富集过程中保真度高,不存在碱基偏好性。
下游应用
适用范围:适用于 Illumina 高通量测序平台 RNA 文库的构建。适用样本量:10 ng ~ 1 μg 的总 RNA ;低至 500 pg 起始的动、植物及真菌等的 mRNA。
自备试剂
1 TIANSeq rRNA Depletion Kit (H/M/R) (NR101)
2. TIANSeq Single-Indexed Adapter (Illumina) (NG214)
3. TIANSeq Size Selection DNA Beads (NG316)
4. 无水乙醇
实验结果
宽广的起始量适用范围
不同样本起始量之间FPKM(Exon,5' UTR and 3'UTR fragments) 之间的线性关系
转录本读序分布均一,5'-3' 的偏好性小
用 GeneBody Coverage 分析,天根产品 5'-3' Coverage均一性好
对于高 GC 区域无明显偏好
高GC区域偏好性分析,大鼠 Klf2 (NM_001007684) 基因,GC 含量 66.1%。红色方框内是该基因 GC 含量高的区域。
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