产品简介
TIANSeq rRNA Depletion Kit (H/M/R) 采用特殊设计的DNA 探针与核糖体 RNA(rRNA) 杂交,随后利用 Ribo RNase H 降解 DNA-rRNA 杂交链中的 rRNA,从而去除人、小鼠、大鼠总 RNA 中的细胞质核糖体 RNA(28S、18S、5.8S、5S) 和线粒体内核糖体 RNA(16S、12S),
保留信使 RNA(mRNA) 和其它非编码 RNA。
该试剂盒对于完整和部分降解的总 RNA( 如 FFPE RNA) 均具有良好的 rRNA 去除效果,所获得的去除了rRNA 的 RNA 样本可用于 mRNA 和非编码 RNA 高通量测序,可显著提高测序结果中有效数据比例,纯化产物也可用于随机引物 cDNA 合成或其它下游应用。
产品特点
■ 样本广泛:适用于高质量 ( 完整 ) 及部分降解 ( 如FFPE) 样本中 rRNA 的去除。
■ 高效去除:有效去除 95~99.9% 的人 / 小鼠 / 大鼠的rRNA。
■ 数据全面:保留了不完整mRNA 和非编码RNA 信息,使转录组数据更加全面。
■ 快速评估:试剂盒中提供的引物可快速评估 rRNA 的去除效果。
下游应用
适用范围:适用于 RNA 转录组文库的构建,也可用于随机引物 cDNA 合成或其它下游应用适用样本量:100 ng ~ 1 µg DNA
操作流程示意图
实验结果
Agilent 2100 结果显示对于高质量( 完整 ) 及部分降解样本中rRNA 去除均彻底
小鼠肝脏总 RNA 测序后进行分析,在使用试剂盒去除前 Conctrol 组 rRNA 的reads 占 Mapped reads 总数 85% 以上,TIANGEN 产品去除后 rRNA 的 reads 占比小于 0.2%。
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