特点
产品详情
miScript II RT Kit是miScript PCR System的重要组成部分,用于miRNA定量检测。配合miScript SYBR Green PCR Kit和miScript PCRarrays(miRNome或Pathway-Focused miScript miRNA PCR Arrays)或所需的检测(用于miRNA或其他非编码RNA的miScript Primer Assays、用于miRNA前体的miScript Precursor Assays或用于mRNA的QuantiTect Primer Assays),miScript II RT Kit合成的cDNA可作为real-time PCR 的模板。
miScript II RT Kit缓冲液。
miScript II RT Kit还提供了两种缓冲液。使用miScript HiSpec Buffer合成cDNA,可实现成熟miRNA谱分析(使用miScript miRNA PCR Array)或成熟miRNA的定量(使用miScript Primer Assay)。使用miScript HiFlex Buffer合成cDNA,可实现来自同一cDNA的成熟miRNA、前体miRNA、非编码RNA(ncRNA)和/或mRNA的定量。使用miScript HiSpec Buffer或miScript HiFlex Buffer制备的cDNA可与miScript PCR Controls结合使用。
在miScript HiSpec Buffer中将成熟miRNA选择性转化为cDNA。
在使用miScript HiSpec Buffer进行的逆转录反应中,采用poly(A)聚合酶多腺苷酰化成熟miRNA,并利用逆转录酶及oligo-dT引物扩增将其转变为cDNA。cDNA随后被用于成熟miRNA表达的real-time PCR定量。
在miScript HiFlex Buffer中将各种不同RNA同时转化为cDNA。
在使用miScript HiFlex Buffer进行的逆转录反应中,采用poly(A)聚合酶多腺苷酰化miRNA及其他非编码RNA(ncRNA),并利用逆转录酶及oligo-dT引物扩增将其转变为cDNA。利用oligo-dT和随机引物扩增,使用逆转录酶将mRNA转变为cDNA。使用适当的分析进行成熟miRNA、前体miRNA、其他ncRNA和mRNA检测。
结果具有可重复性。
使用miRNeasy Mini Kit从 [A] 2份相同的HeLa S3细胞沉淀(传代次数相同)和 [B] 2份于不同时间取自不同亲本的HeLa S3细胞沉淀中纯化总RNA。使用miScript PCR System制备cDNA,在real-time PCR中用作模板,进行miFinder miScript miRNA PCR Array分析。重复样本的CT值曲线说明其结果的可重复性高。上述实验是由首次使用miScript PCR System的用户完成的。
性能
miScript II RT Kit配合miScript PCR System的其他组分,灵敏和特异性地检测并定量miRNA。由于许多miRNA表达水平低,灵敏度特别重要,以确保数据的可靠。miScript PCR System灵敏度高、动态范围广和持续高扩增率。其卓越的性能使得初次尝试时即可获得高度重复性结果。
miRNAs存在许多miRNA亚型家族,有些只是单个碱基的不同。这使得miRNA定量面临很大挑战。miScript PCR System可有效识别紧密相关的miRNA亚型,即使是只有单个碱基不同的miRNA也可(见表)。
miRNA序列 | |
---|---|
Let-7b | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU |
Let-7c | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU |
miR-98 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU |
Let-7d | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGUU |
Let-7e | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGUU |
Let-7a | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
Let-7f | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU |
Let-7g | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGUU |
Let-7i | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGUU |
Let-7亚型的RNA序列已列出。粗体有下划线部分为碱基变化。使用miScript II RT Kit和miScript HiFlex Buffer,每个Let-7亚型(Let-7a-Let-7i和miR-98)的合成miRNAs用于cDNA合成反应。相同的实验也可使用miScript HiSpec Buffer,获得相同的结果(数据未列出)。不同cDNA的等分试样作为real-time PCR反应的模板,配合适合不同亚型miScript Primer Assay和miScript SYBR® Green PCR Kit使用。%相对检测值为所有与miScript Primer Assays不匹配和匹配的CT值的差值(%相对检测值= 2-ΔCT x 100)。其值表明miScript PCR System有效识别紧密相关的亚型家族的能力。
用于PCR的cDNA | Let-7b | Let-7c | miR-98 | Let-7d | Let-7e | Let-7a | Let-7f | Let-7g | Let-7i |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Let-7b | 100.00 | 1.78 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.01 |
Let-7c | 0.54 | 100.00 | 0.00 | 0.00 | 1.01 | 0.12 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
miR-98 | 0.00 | 0.21 | 100.00 | 0.06 | 0.01 | 0.05 | 0.00 | 0.01 | 0.13 |
Let-7d | 0.05 | 0.02 | 0.00 | 100.00 | 0.00 | 0.38 | 0.00 | 0.00 | 0.01 |
Let-7e | 0.05 | 0.01 | 0.00 | 0.02 | 100.00 | 0.23 | 0.00 | 0.00 | 0.01 |
Let-7a | 0.07 | 0.64 | 0.00 | 0.54 | 3.86 | 100.00 | 0.06 | 0.04 | 0.02 |
Let-7f | 0.55 | 0.12 | 0.01 | 0.11 | 0.03 | 1.05 | 100.00 | 0.14 | 0.13 |
Let-7g | 0.58 | 0.17 | 0.01 | 0.08 | 0.00 | 0.04 | 0.01 | 100.00 | 0.17 |
Let-7i | 0.13 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.00 | 0.01 | 0.00 | 0.10 | 100.00 |
原理
miScript PCR System应用SYBR Green-based real-time PCR,能够灵敏和特异性地进行miRNA的定量和谱分析。miScript PCR System可以完成从RNA中合成cDNA及后续的real-time PCR检测miRNAs涉及的所有步骤。
miScript PCR System包含以下组分:
miScript II RT Kit包含miScript Reverse Transcriptase Mix、10x miScript Nucleics Mix、5x miScript HiSpec Buffer和5x miScript HiFlex Buffer。miScript Reverse Transcriptase Mix是一种经优化的poly(A)聚合酶和逆转录酶混合物。miScript Nucleics Mix包含dNTPs、rATP、oligo-dT引物和内部合成RNA对照(miRNA逆转录对照[miRTC]),可评估使用miScript miRNA PCR Arrays进行谱分析实验的逆转录性能(获取更多信息,请参考miScript miRNA PCR Array Handbook)。
miScript II RT Kit提供两种缓冲液:miScript HiSpec Buffer和miScript HiFlex Buffer,满足使用real-time PCR进行miRNA定量研究的特别要求。miScript HiSpec Buffer配合miScript miRNA PCR Arrays和miScript Primer Assays进行成熟miRNA谱分析和定量实验时,提供理想的结果。miScript HiFlex Buffer适合于低通量miRNA定量实验,从同一样本进行如miRNA、mRNA和前体miRNA等不同种类的RNA的定量实验除外。
使用miScript HiSpec Buffer进行逆转录反应,确保成熟miRNAs的选择性转化,miScript PCR Controls靶向转至cDNA。使用oligo-dT引物,成熟miRNAs通过poly(A)聚合酶加尾后,被逆转录至cDNA。加尾和逆转录在同一试管内同时进行。oligo-dT引物有一个3'退化锚点和一个在5'端的通用标签序列,可在real-time PCR步骤扩增成熟miRNA。miScript Primer Assays配合miScript SYBR Green PCR Kit,确保通过real-time PCR灵敏、特异性的定量miRNA。加尾和通用标签保证miScript Primer Assays不会检测到基因组DNA。
使用miScript HiFlex Buffer进行逆转录反应,可使所有种类的RNA转化至cDNA。使用oligo-dT引物,成熟miRNAs通过poly(A) 聚合酶加尾后,被逆转录至cDNA。加尾和逆转录在同一试管内同时进行。oligo-dT引物有一个3'退化锚点和一个在5'端的通用标签序列,可在real-time PCR步骤扩增成熟miRNA。miScript Primer Assays配合miScript SYBR Green PCR Kit,确保通过real-time PCR定量miRNA。加尾和通用标签确保miScript Primer Assays不会检测到基因组DNA。其它种类RNA(包括miRNA前体、其它非编码RNA和mRNA)使用oligo-dT和随机引物转化至cDNA。配合miScript SYBR Green PCR Kit,使用合适的检测进行real-time PCR的RNAs检测(如用于非编码RNA检测的miScript Primer Assays 、用于miRNA前体检测的miScript Precursor Assays和用于mRNA检测的QuantiTect Primer Assays)。
操作流程
逆转录反应操作简单。包含miRNA的总RNA作为逆转录反应的起始材料。逆转录是一个简单的流程,包括在37oC条件下进行1个小时的孵育反应及在95oC条件下的简单孵育后进行的灭活反应。
应用
miScript II RT Kit作为miScript PCR System的一部分,用于:
· 成熟miRNA定量检测和谱分析
· 同时检测miRNA和mRNA
· 同时检测miRNA和miRNA前体
· 检测snoRNA和其它非编码RNA
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